Примеры результатов
Секвенирование и фрагментный анализ в прикладных задачах
НАНОФОР 05 формирует STR-профили, микросателлитные профили и электрофореграммы секвенирования для прикладных генетических исследований.
- STR-профилирование
- Микросателлитный анализ
- Секвенирование по Сэнгеру
Методы
Фрагментный анализ измеряет длину, секвенирование определяет последовательность
НАНОФОР 05 применяется как для чтения нуклеотидной последовательности, так и для измерения длины флуоресцентно меченных фрагментов ДНК.
Фрагментный анализ
STR-профили, микросателлитные маркеры, анализ числа повторов, аллельные лестницы и стандарты длин.
Секвенирование по Сэнгеру
Определение последовательности целевых участков ДНК для идентификации видов, анализа локусов и подтверждения вариантов.
Прикладные направления
Что показывает анализатор в прикладных исследованиях
Галереи показывают аллельные лестницы, контрольные образцы, профили микросателлитных маркеров и электрофореграммы секвенирования.
Криминалистика
Фрагментный анализ STR-панелей: аллельные лестницы, положительные контроли и профили для идентификационных исследований.
- Показаны аллельные лестницы и положительные контроли PowerPlex® Fusion 6C, VeriFiler™ Express и GlobalFiler™.
- Набор Human ID включает 31 STR-локус; в галерее приведены лестница, контроль и профиль образца.
- Все показанные профили получены методом капиллярного электрофореза на НАНОФОР 05.
Медицинские исследования
Фрагментный анализ повторов и микросателлитных маркеров в генах UGT1A1, AR и HTT, а также панели MSI.
- Для UGT1A1 показаны профили числа TA-повторов в промоторной области гена.
- Отдельные электрофореграммы демонстрируют анализ повторов в генах AR и HTT.
- Пример MSI показывает профиль по панели из 15 микросателлитных маркеров.
Животноводство
Микросателлитное генотипирование крупного рогатого скота, свиней, овец и лошадей.
- Gene Profile Cattle охватывает 16 микросателлитных локусов.
- Gene Profile Pig+ включает 21 локус, Gene Profile Sheep — 12 локусов и маркер амелогенина.
- Gene Profile Horse используется для генотипирования по 17 микросателлитным локусам.
Ветеринария
Секвенирование целевого локуса E в исследовании генетически обусловленного окраса собак.
- В примере показана электрофореграмма секвенирования локуса E.
- Разделение выполнено на полимере ПДМА-6 с капиллярами длиной 36 см.
- Данные предоставлены ветеринарной лабораторией «ПОИСК» в Санкт-Петербурге.
Рыбное хозяйство и аквакультура
Фрагментный анализ семи STR-локусов осетровых с набором «ГенЭксперт-Осётр».
- В галерее представлены аллельная лестница и профиль образца.
- Набор «ГенЭксперт-Осётр» использует семь STR-локусов.
- ПЦР-продукты разделены методом капиллярного электрофореза на НАНОФОР 05.
Растениеводство
Микросателлитные профили картофеля и винограда для сравнения и генетической паспортизации образцов.
- Для картофеля показан профиль по 12 микросателлитным локусам.
- Для винограда показан профиль по девяти микросателлитным локусам.
- Оба примера получены методом фрагментного анализа на НАНОФОР 05.
Карантин растений
Секвенирование митохондриальной ДНК для видовой идентификации шелкопряда-монашенки Lymantria monacha.
- Показана электрофореграмма митохондриальной ДНК Lymantria monacha.
- Разделение выполнено на полимере ПДМА-6 с капиллярами длиной 50 см.
- Последовательность обработана в программе Mutation Surveyor®.
Фундаментальные исследования
Секвенирование ITS-региона Glycyrrhiza inflata методом Сэнгера.
- В примере показана электрофореграмма ITS-региона Glycyrrhiza inflata.
- Разделение выполнено на полимере ПДМА-6 с капиллярами длиной 50 см.
- Данные предоставлены ФИЦ Коми НЦ УрО РАН в Сыктывкаре.
Методическая поддержка
Обсудите применимость метода для своей задачи
Специалисты СИНТОЛ консультируют по секвенированию по Сэнгеру, фрагментному анализу, подбору реагентов и анализу данных.