Центр помощи НАНОФОР 05

Включите лазер перед запуском сервисной процедуры (Сервис → «Включение лазера»). Для выключения лазера выберите Сервис → «Завершение работы»

Установите линейку капилляров (Помощники → «Замена линейки капилляров»).

При выключенном лазере убедитесь, что кольцо на оптическом окне смотрит на вас.

Выньте и вставьте конец кабеля USB 3.0 в приборе и в компьютере. В компьютере вставьте кабель USB 3.0 в соседний синий порт, перезагрузите прибор и компьютер.

Увеличьте напряжение/время ввода пробы (до 3 000 000 RFU).

Приготовьте новую реакцию со свежим калибратором.

Используйте свежий деионизованный формамид Di-Fa.

Добавьте больше стандарта в смесь. Оптимальное количество калибратора указано в Методических рекомендациях НАНОФОР 05.

Установите верный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте планшеты или стрипы, указанные в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05. Пластик с неподходящей геометрией может повредить капилляры и привести к нестабильной загрузке образцов.

Уменьшите время и/или напряжение ввода пробы.

Приготовьте новую реакцию, добавив меньше калибратора. Оптимальное количество калибратора указано в Методических рекомендациях НАНОФОР 05.

Убедитесь, что используете верный спектральный калибратор.

Выберите правильный набор.

Повторите калибровку на стандартном модуле.

Проверьте тип полимера в свойствах проекта и в приборе (например, ПДМА-4 или ПДМА-6).

Увеличьте время электрофореза или замените полимер с промывкой помпы водой.

Уменьшите время исключения в модуле.

Адаптируйте параметры модуля или используйте полимер «Синтол».

Используйте новый спектральный калибратор.

Повторите спектральную калибровку. Если спайк-пики мешают прохождению — замените полимер с промывкой водой.

Задайте верный порядок согласно инструкции производителя и повторите калибровку.

Тщательно вымойте контейнеры, замените септы и жидкости, повторите калибровку. Либо увеличьте время исключения регистрации сигнала электрофореза для исключения зоны выхода праймеров и повторите калибровку.

Денатурируйте согласно инструкции к калибратору (или соответствующему набору)

Замените линейку капилляров на новую. Проблема характерна для капилляров с большим пробегом или после длительной консервации.

Установите верный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте планшеты или стрипы, указанные в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05. Пластик с неподходящей геометрией может повредить капилляры и привести к нестабильной загрузке образцов.

Откройте правую дверцу, подождите 10 сек, закройте. После выдвижения позиционера дверь можно закрывать не ранее, чем через 10 секунд.

1. Чтобы позиционер вернулся в исходное положение — откройте правую дверцу, подождите 10 сек, закройте (Нажимайте кнопку «Загрузка» не более 1 секунды — до начала движения позиционера). 2. Чтобы позиционер выехал в переднее положение — нажмие кнопку «Загрузка» не более 1 секунды

Запустите помощник «Замена полимера» с промывкой водой.

Воспользуйтесь помощником «Удаление пузырей», стабилизируйте температуру в лаборатории.

Обратитесь в техническую поддержку..

Согревайте новый полимер до комнатной температуры 30 мин перед установкой.

Проведите процедуру удаления пузырей.

Ослабьте крышку банки с полимером для поступления воздуха.

Запустите штатную промывку водой и замену полимера через помощники управляющей программы. Если канал не промывается, остановите процедуру и обратитесь в техническую поддержку.

Прижмите планку к термостату и зафиксируйте обе клипсы.

Замените капилляры, правильно устанавливайте держатель и фиксатор ванночек.

Используйте новый держатель из комплектации.

Обратитесь в техническую поддержку

Замените капилляры. Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Используйте режим усиленного заполнения. Если не помогло — замочите концы в воде на сутки, повторите. Если не помогло — замените линейку.

Замена линейки капилляров.

Обратитесь в техническую поддержку..

Обратитесь в техническую поддержку.

Обратитесь в техническую поддержку.

Установите новую линейку капилляров

Регулярно меняйте буфер и воду в контейнерах, следите за уровнем.

Замена линейки капилляров.

Понизьте температуру до 15-30 °C.

Отсутствует заземление. Подключите кабель питания ИБП прибора к розетке с заземлением.

Во время анализа была открыта дверь. Закройте дверь, перезапустите анализ.

Замените буфер.

Приготовьте и установите свежий буфер.

После промывки водой всегда инсталлируйте полимер по помощнику Замена полимера.

Выньте наконечник капилляров, промойте его деионизованной водой, затем заново зафиксируйте наконечник капилляров, промойте водой место стыка капилляров и блока заполнения через специальное отверстие в блоке

Обратитесь в техническую поддержку.

Используйте стандартный модуль.

Обратитесь в техническую поддержку

Проведите промывку водой (помощник «Промывка водой») и замените полимер на свежий

Включите прибор.

Соедините прибор и компьютер.

Подключите в синий порт USB 3.0.

Переподключите в другой порт или замените кабель (через техническую поддержку).

Экспортируйте логи и свяжитесь с технической поддержкой

Дождитесь прогрева прибора

Экспортируйте логи и свяжитесь с технической поддержкой

Включите лазер.

Проверьте/замените USB 3.0 кабель.

Закройте ПО, перезагрузите компьютер и прибор, конвертируйте вручную («Проект» — «Экспорт в ab1/fsa»). Установите актуальную версию управляющего ПО.

Закройте ПО, перезагрузите, конвертируйте вручную («Проект» — «Экспорт в ab1/fsa»). Не открывайте «ДНК АЛ» во время работы прибора.

Перезагружайте компьютер раз в неделю. Установите актуальную версию управляющего ПО.

Перезагрузите компьютер, повторите калибровку. Установите актуальную версию управляющего ПО.

Перепроверьте и возьмите рекомендованное количество качественной ДНК.

Перепроверьте и возьмите рекомендованное количество качественного праймера.

Перепроверьте состав реакционной смеси.

Используйте свежие реактивы с актуальным сроком годности.

Проверьте программу, используйте исправный термоциклер.

Проверьте протокол очистки (концентрация спирта при спиртовом осаждении, модель вортекса — в случае наборов типа BigDye XTerminator/iX-Pure/BDX).

Используйте свежие деионизованные воду и формамид, замените полимер/капилляры, обратитесь к блоку «Устранение неполадок в приборе» или в техническую поддержку.

Проверьте и оптимизируйте количество.

Оптимизируйте очистку (дополнительный этап промывки при очистке магнитными частицами, разбавление готовой смеси особенно при спиртовой очистке, плотное крепление плашки на вортексе в случае наборов типа BigDye XTerminator/iX-Pure/BDX).

Подтвердите прочтением в противоположном направлении. Это биологическая особенность.

Замените септы, жидкости, приготовьте образцы заново.

Промойте емкости деионизованной водой.

Проведите спектральную калибровку.

Скорректируйте температуру отжига праймера, оптимизируйте условия реакции, используйте полимеразу с горячим стартом (например, SynTaq) или спроектируйте новый праймер.

Очистите продукт ПЦР гель-электрофорезом или спроектируйте новые праймеры.

Полностью очистите продукт ПЦР от праймеров.

Проверьте качество ДНК. Убедитесь, что на этапе ПЦР используются высокоспецифические праймеры только к целевой ДНК-матрице

Пересинтезируйте или используйте ВЭЖХ-очистку праймера.

Уменьшите количество ДНК, время инъекции, используйте стандартные модули. Сигнал должен быть до 3 000 000 RFU.

Используйте якорные секвенирующие праймеры.

Увеличьте температуру отжига.

ПЦР праймеры не должны образовывать димеры. Подберите и закажите новые праймеры.

Оптимизируйте способ очистки ПЦР. Например, используйте набор SynMag (Синтол) для очистки на магнитных частицах.

Замените все реагенты и воду, почистите дозаторы.

Уменьшите напряжение и/или время ввода пробы.

Возьмите меньше продукта, разведите образец, уменьшите количество ДНК или циклов амплификации, используйте стандартные модули управления. При очистке BigDye XTerminator сигнал как правило выше, чем при очистке спиртом

Замените септы, жидкости, приготовьте образцы заново. Регулярно меняйте септы контейнеров при замене буфера (минимум раз в неделю).

Промойте емкости деионизованной водой. Регулярно меняйте воду и буфер на свежие деионизованные.

Промывайте контейнеры деионизованной водой минимум 3 раза.

Перед калибровкой/секвенированием промойте контейнеры, замените жидкости и септы.

Протрите прибор, промойте насос водой, замените полимер.

Работайте только в неопудренных перчатках.

Проведите спектральную калибровку.

Скорректируйте температуру отжига праймера, оптимизируйте условия реакции, используйте полимеразу с горячим стартом (например, SynTaq) или спроектируйте новый праймер.

Очистите продукт ПЦР гель-электрофорезом или спроектируйте новые праймеры.

Полностью очистите продукт ПЦР от праймеров.

Проверьте качество ДНК.

Пересинтезируйте или используйте ВЭЖХ-очистку праймера.

Используйте якорные секвенирующие праймеры.

Увеличьте температуру отжига.

ПЦР праймеры не должны образовывать димеры. Подберите и закажите новые праймеры.

Оптимизируйте способ очистки ПЦР. Например, используйте набор SynMag (Синтол) для очистки на магнитных частицах.

Замените все реагенты и воду, почистите дозаторы.

Уменьшите напряжение и/или время ввода пробы. Сигнал должен быть до 3 000 000 RFU.

Уменьшите количество ДНК, время инъекции, используйте стандартные модули. Сигнал должен быть до 3 000 000 RFU.

Возьмите меньше продукта, разведите образец, уменьшите количество ДНК или циклов амплификации, используйте стандартные модули управления. При очистке BigDye XTerminator сигнал как правило выше, чем при очистке спиртом

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Проведите запуск на стандартных параметрах, увеличьте напряжение/время.

Подготовьте пробы объемом не менее 10 мкл.

Добавляйте образец с запасом (15 мкл), если загрузка в прибор не в формамиде.

Используйте ДНК высокой очистки в рекомендованном количестве.

Используйте высокоочищенный праймер в достаточном количестве.

Используйте свежие реагенты, проверьте протокол.

Используйте свежий деионизованный формамид.

Используйте рекомендованные режимы (1800-2600 об/мин, 30 мин — в зависимости от модели шейкера).

Используйте реагенты, нагретые до комнатной температуры.

Многократно промойте систему водой (помощник «Промывка водой»), замените жидкости и септы.

Увеличьте время элонгации или уменьшите температуру.

Проанализируйте метод выделения, переочистите матрицу.

Проверьте и используйте рекомендованное количество.

Проверьте и используйте рекомендованное количество.

Следуйте рекомендациям по приготовлению реакций.

Используйте другой метод выделения, храните матрицу при -20°C.

Попробуйте альтернативную химию (например, dGTP).

Промойте блок водой (7+ циклов в помощнике «Промывка водой»), замените полимер, при необходимости — капилляры.

Замените септы на новые, не используйте мытые. Если не помогло, то многократно промойте систему водой (помощник «Промывка водой»), замените жидкости и септы.

Удалите пузыри и заполните капилляры.

Замените капилляры.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Подготовьте пробы объемом не менее 10 мкл.

Удалите пузыри с помощью помощника Заполнение капилляров полимером.

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Запустите усиленное заполнение полимером. Если полимер не вытекает — сделайте замену капилляров.

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Запустите усиленное заполнение полимером. Если полимер не вытекает — сделайте замену капилляров.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Используйте свежий деионизованный формамид.

Соблюдайте рекомендации по минимальному объему образца (10 мкл).

Центрифугируйте планшет перед установкой.

Подготовьте пробы заново.

Запустите усиленное заполнение полимером. Если полимер не вытекает — сделайте замену капилляров.

Проведите пространственную и спектральные калибровки.

Убедитесь в наличии продукта ПЦР — проведите гель-электрофорез в агарозе.

Проверьте используемый протокол очистки реакции секвенирования. Например, концентрацию спирта при спиртовом способе очистки. Или подходит ли используемая модель вортекса для очистки набором XTerminator/iXPure.

Проведите тест термоциклера. Используйте в работе только исправные термоциклеры

Тщательно проверьте протокол эксперимента
— проверьте количество и качество каждого компонента реакции
— замените каждый компонент и повторите секвенирование, пока не найдется проблема или пока не будут заменены все компоненты
— поставьте контрольную реакцию с pGEM. Так можно узнать, проблема в качестве/количестве ДНК/праймера или в протекании реакции секвенирования

Перепроверьте качество/количество ДНК

Используйте рекомендации по подготовке образца. Проверьте качество образца. Если необходимо, сделайте переочистку.

Поставьте контрольную реакцию с pGEM для проверки полимеразы.

Включите лазер перед пространственной калибровкой.

Проверьте USB 3.0 соединение, замените кабель.

Свяжитесь с поддержкой для очистки окна и замены капилляров.

Замените септы на новые, не используйте моющие средства.

Замените полимер с промывкой водой.

Замените капилляры.

Удалите пузыри и заполните капилляры полимером.

Замените капилляры.

Удалите пузыри и заполните капилляры полимером.

Замените капилляры.

Промойте систему водой, замените полимер, возможно — капилляры.

Ослабьте крышечку на банке с полимером, прокачайте полимер.

Не замораживайте полимер. Сделайте промывку водой и замените полимер.

Протрите прибор, замените полимер с промывкой. Работайте в неопудренных перчатках.

Сделайте заполнение капилляров, повторите инъекцию.

Проведите водную промывку блока заполнения и замену полимера.

Всегда используйте функцию промывки водой.

Используйте полимер в индивидуальных банках, не доливайте.

Сделайте промывку водой помпы и замену полимера.

Обратитесь к производителю полимера.

Используйте свежий деионизованный формамид.

Работайте только в неопудренных перчатках.

Действий не требуется. При необходимости сократите время электрофореза, чтобы пик не попадал в регистрируемый диапазон.

Получите более длинные ампликоны.

Используйте модуль Standard.

Замените капилляры или полимер.

Замените полимер с промывкой водой

Замените полимер с промывкой водой либо увеличьте время электрофореза в настройках Модуля управления

Промойте насос водой (помощник «Промывка водой»), установите новый полимер (помощник «Замена полимера»).

Проверьте партию буфера, замените на другой.

Во вкладке Process — Settings — Input установите Load Raw Data и перезайдите в программу.

Во вкладке Process — Settings — Input установите Load Processed Data и перезайдите в программу.

Включите тумблер.

Проверьте соединения внутри блока, особенно PowerSwitch. Обратитесь в техническую поддержку.

Замените буфер, полимер, используйте свежий деионизованный формамид.

Замените капилляры.

Промойте систему водой, замените полимер, замените капилляры.

Приведите параметры к стандартным в модуле.

Приведите в соответствие тип полимера и модуль.

Оптимизируйте стандартный модуль. Например, уменьшите параметр Время исключения регистрации электрофореза.

В GeneMapper задайте «Full range», в GeneMarker — «Raw data analysis-Auto range».

Приведите время к стандартному.

Увеличьте время электрофореза. Либо сделайте промывку водой и замените полимер на свежий.

Приведите в соответствие тип полимера и модуль.

Оптимизируйте стандартный модуль. Например, увеличьте параметр Время электрофореза.

В GeneMapper задайте «Full range», в GeneMarker — «Raw data analysis-Auto range».

Повторите электрофорез, добавив стандарт длин в соответствии с инструкцией к набору.

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Используйте свежий высокоочищенный формамид.

Обратитесь к производителю стандарта.

Повторите инъекцию или проведите промывку насоса водой, замену полимера, замену капилляров.

Протрите поверхности прибора влажной безворсовой салфеткой, замените полимер с промывкой, выгоните пузыри.

Уменьшите напряжение/время инъекции, разведите образец.

Используйте рекомендованную производителем набора спектральную калибровку.

Замените буфер, полимер и/или капилляры. Используйте свежий формамид.

См. проблемы со слабым/нестабильным сигналом.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Добавьте стандарт в объёме, указанном в инструкции к набору.

Обратитесь к производителю.

Установите актуальную версию управляющего ПО.

Переподпишите пики размерного стандарта.

См. проблемы со слабым/нестабильным сигналом.

Уменьшите напряжение и/или время ввода пробы.

Возьмите меньше продукта, разведите образец, внесите меньше ДНК на этапе амплификации, оптимизируйте условия реакции, используйте стандартные модули.

Регулярно меняйте септы согласно рекомендациям.

Замените воду в контейнерах на свежую деионизованную. Регулярно меняйте.

Промывайте контейнеры деионизованной водой 3 раза.

Протрите прибор, промойте насос водой, замените полимер с усиленным заполнением.

См. причины и решения в блоке «Сильный сигнал»

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Запустите усиленное заполнение полимером. Если полимер не вытекает — сделайте замену капилляров.

Проведите запуск на стандартных параметрах, увеличьте напряжение/время.

Подготовьте пробы объемом не менее 10 мкл.

Добавляйте образец с запасом (15 мкл), если загрузка в прибор не в формамиде.

Используйте свежий деионизованный формамид.

Используйте качественные компоненты в нужном количестве, проверьте протокол.

Разведите или почистите образец ДНК.

Перевыделите ДНК.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Подготовьте пробы объемом не менее 10 мкл.

Удалите пузыри с помощью помощника Заполнение капилляров полимером.

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Запустите усиленное заполнение полимером. Если полимер не вытекает — сделайте замену капилляров.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Используйте свежий деионизованный формамид.

Соблюдайте рекомендации по минимальному объему образца (10 мкл).

Центрифугируйте планшет перед установкой.

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Подготовьте пробу заново, не забудьте добавить образец

Запустите усиленное заполнение полимером. Если полимер не вытекает — сделайте замену капилляров.

Проведите пространственную и спектральные калибровки.

Проверьте USB 3.0 соединение, замените кабель.

Свяжитесь с поддержкой для очистки окна и замены капилляров.

Используйте пластик, указанный в актуальном руководстве пользователя и перечне расходных материалов НАНОФОР 05.

Запустите усиленное заполнение полимером. Если полимер не вытекает — сделайте замену капилляров.

Выберите правильный тип: «Планшет» или «Стрип».

Обратитесь в техническую поддержку для настройки позиционера.

Замените септы на новые.

Удалите пузыри и заполните капилляры полимером.

Понизьте время и/или напряжение ввода пробы и выполните реинъекцию образца.

Замените капилляры.

Промойте систему водой, замените полимер, возможно — капилляры.

Ослабьте крышечку на банке с полимером, прокачайте полимер.

Замените полимер и/или капилляры, оптимизируйте напряжение и время электрофореза.

Не замораживайте. Сделайте промывку водой и замените полимер.

Протрите прибор, замените полимер с промывкой. Работайте в неопудренных перчатках.

Сделайте заполнение капилляров, повторите инъекцию.

Проведите водную промывку блока заполнения и замену полимера.

Всегда используйте функцию промывки водой.

Используйте полимер в индивидуальных банках, не доливайте.

Сделайте промывку водой помпы и замену полимера.

Обратитесь к производителю полимера.

Используйте свежий деионизованный формамид.

Работайте только в неопудренных перчатках.

Замените на полимер ПДМА-6.

Выровняйте панель по аллельному леддеру или положительному контрольному образцу.

Выберите правильный стандарт длин.

Переподпишите стандарт длин

Используйте правильный лэддер

Используйте свежий и правильно хранящийся лэддер

Промойте насос водой, установите новый полимер.

Проверьте партию буфера, замените на другой.

Выберите правильный стандарт длин.

См. проблемы со слабым/нестабильным сигналом.

Убедитесь, что выбран правильный размерный стандарт.

Замените полимер на свежий.

Измените настройки ПО для анализа.

Убедитесь, что используется правильная версия панели, соответствующая набору праймеров и условиям капиллярного электрофореза.

Настройте параметры фильтрации статтера в ПО или оптимизируйте условия ПЦР для уменьшения артефакта.

Разбавьте образец, проведите дополнительную очистку (осаждение этанолом, осаждение на магнитных частицах).

Проведите усиленную промывку системы (водой, затем полимером). Если не помогает — замените капилляры.

1. Оптимизируйте количество ДНК. 2. Скорректируйте программу термоциклера. 3. Используйте свежий фермент, хранящийся при правильной температуре.

1. Определите индекс деградации ДНК с помощью набора Real Quant H3 методом ПЦР в реальном времени (для ДНК человека). 2. Используйте методы очистки от ингибиторов. 3. Оптимизируйте количество ДНК в реакции.

Включите тумблер.

Проверьте соединения внутри блока, особенно PowerSwitch. Обратитесь в техническую поддержку.

Проведите оптимизацию ПЦР (титрование компонентов, программа ПЦР), проверьте качество ДНК.

Повысьте температуру отжига, используйте полимеразу с горячим стартом, закажите праймеры заново, готовьте смесь в чистой зоне.

Подберите новые последовательности праймеров, снизьте концентрацию праймеров, оптимизируйте температуру отжига праймеров.

Разбавьте образец, используйте методы очистки ДНК, включающие удаление ингибиторов или добавьте в реакцию BSA или другие добавки, снижающие ингибирование.

Увеличьте время начальной денатурации (до 5 минут при 95°C) и убедитесь, что термоциклер выходит на заданную температуру.

Организуйте физическое разделение зон для разных этапов работы, используйте ультрафиолетовые лампы для дезинфекции, регулярно меняйте расходные материалы.

Прибор в упаковке необходимо выдержать не менее 24 часов на комнатной температуре после длительной транспортировки при температуре ниже комнатной.

Поддерживайте в лаборатории рекомендованные условия влажности (20-80%) и температуры (15-30 °C).

Установите фильтры очистки воздуха, проводите регулярную влажную уборку.

Не используйте хлорсодержащие жидкости в помещении, в котором установлен прибор

Используйте антииспарители для планшетов или увеличивайте стартовый объем пробы, если проба не в формамиде, а в водном растворе.

Установите прибор в помещении с системой фильтрации воздуха, регулярно проводите влажную уборку помещения.