Микросателлиты — это участки ДНК, содержащие короткие тандемные повторы (повторяющиеся последовательности длиной 1–6 нуклеотидных пар). Обычно такие ошибки исправляются системой репарации, однако при нарушении работы системы репарации в клетках изменяется количество тандемных повторов. Это, в свою очередь, способно играть важную роль в развитии онкологических заболеваний. Стандарт длин СД-240 мечен красителем Sy660. Использование пяти красителей позволяет одновременно детектировать 15-ть ампликонов и стандарт длин в одном капилляре.

Подобные микросателлитные мутации, возникающие в кодирующих последовательностях, интронах или регуляторных областях генов, могут влиять на экспрессию генов или функцию белков — как положительно, так и отрицательно. Оценка MSI используется диагностически для обнаружения и классификации опухолей. Кроме того, обнаружение микросателлитной нестабильности служит важным диагностическим признаком синдрома Линча — аутосомно-доминантного синдрома, вызываемого мутациями в системе репарации ДНК.

Поддержка анализа данных в программе GeneMapper/GeneMarker.

Они могут появляться в любом участке генома, чаще всего из-за проскальзывания ДНК-полимеразы во время репликации. Используемые в наборе праймеры мечены красителями FAM, R6G, TAMRA, ROX, Sy630 (см. таблицу 1). Набор адаптирован для использования на генетических анализаторах Нанофор 05/Applied Biosystems 3500 / 3500 XL.