Синтез для лабораторных задач
Синтез олигонуклеотидов
Подготовьте стандартные и модифицированные последовательности, выберите очистку, контроль качества, фасовку и формат поставки. Система проверит параметры и рассчитает предварительную стоимость до отправки запроса.
Для списков доступны импорт Excel, CSV и вставка из буфера обмена.
Производство и контроль
Что происходит с последовательностью после отправки запроса
Олигонуклеотид проходит автоматический амидофосфитный синтез, деблокирование, выбранную очистку, обессоливание, количественное измерение и контроль. Вместе с продуктом предоставляются паспортные данные, необходимые для расчёта рабочих растворов.
Для стандартных и модифицированных олигонуклеотидов заявляется чистота не менее 95% при предусмотренном производственном маршруте.
Количество и концентрацию определяют спектрофотометрически с учётом состава и последовательности.
Обычно продукт поставляется лиофилизованным либо растворённым в деионизированной воде Milli-Q по согласованию.
В документе указываются последовательность, длина, количество, концентрация, молярная масса и очистка.
Производственный маршрут
От твёрдофазного синтеза до готового продукта
Каждый этап решает отдельную задачу: собрать цепь, снять защитные группы, отделить полноразмерный продукт, удалить соли и измерить фактическое количество.
-
Амидофосфитный синтез
Последовательность наращивается на автоматическом синтезаторе по одному звену. Длина и химический состав определяют сложность дальнейшей очистки.
-
Деблокирование
После синтеза продукт снимают с полимерного носителя и удаляют защитные группы, использованные во время сборки цепи.
-
Очистка
ПААГ и/или обращённо-фазовая ВЭЖХ отделяют полноразмерный олигонуклеотид от укороченных продуктов и непрореагировавших компонентов.
-
Обессоливание и измерение
После очистки удаляют соли, измеряют поглощение при 260 нм и рассчитывают концентрацию с учётом коэффициента экстинкции.
-
Контроль качества
Проверяется не только количество
Набор процедур зависит от конструкции.
- Внешний вид и концентрация
- Полноразмерность
- Хроматографический профиль
- Функциональность модификаций
-
Паспорт продукта
Данные для воспроизводимой работы в лаборатории
Паспорт связывает заказанную конструкцию с фактически выданным материалом и помогает корректно приготовить рабочие растворы.
- Идентификация
- Количество
- Концентрация
- Характеристики
Контроль качества
Проверяется не только количество
Набор процедур зависит от конструкции. Для немодифицированных и меченых олигонуклеотидов используются разные способы подтверждения результата.
Обессоливание и измерение
После очистки удаляют соли, измеряют поглощение при 260 нм и рассчитывают концентрацию с учётом коэффициента экстинкции.
Контроль качества
Проверяется не только количество
Набор процедур зависит от конструкции.
- Внешний вид и концентрация Раствор контролируют визуально; количество и концентрацию определяют по УФ-поглощению.
- Полноразмерность Гель-электрофорез с маркерами длин позволяет оценить положение целевого продукта и наличие укороченных фрагментов.
- Хроматографический профиль По запросу может выполняться аналитическая обращённо-фазовая или ион-парная ВЭЖХ с предоставлением профиля разделения.
- Функциональность модификаций Флуоресцентные метки, биотин, аминогруппы и фосфатные группы подтверждаются специализированными реакциями и аналитическими методами.
Паспорт продукта
Данные для воспроизводимой работы в лаборатории
- Идентификация
- Количество
- Концентрация
- Характеристики
Производственный маршрут
От твёрдофазного синтеза до готового продукта
Каждый этап решает отдельную задачу: собрать цепь, снять защитные группы, отделить полноразмерный продукт, удалить соли и измерить фактическое количество.
1. Амидофосфитный синтез
Последовательность наращивается на автоматическом синтезаторе по одному звену. Длина и химический состав определяют сложность дальнейшей очистки.
2. Деблокирование
После синтеза продукт снимают с полимерного носителя и удаляют защитные группы, использованные во время сборки цепи.
3. Очистка
ПААГ и/или обращённо-фазовая ВЭЖХ отделяют полноразмерный олигонуклеотид от укороченных продуктов и непрореагировавших компонентов.
4. Обессоливание и измерение
После очистки удаляют соли, измеряют поглощение при 260 нм и рассчитывают концентрацию с учётом коэффициента экстинкции.
Контроль качества
Проверяется не только количество
Набор процедур зависит от конструкции. Для немодифицированных и меченых олигонуклеотидов используются разные способы подтверждения результата.
Внешний вид и концентрация
Раствор контролируют визуально; количество и концентрацию определяют по УФ-поглощению.
Полноразмерность
Гель-электрофорез с маркерами длин позволяет оценить положение целевого продукта и наличие укороченных фрагментов.
Хроматографический профиль
По запросу может выполняться аналитическая обращённо-фазовая или ион-парная ВЭЖХ с предоставлением профиля разделения.
Функциональность модификаций
Флуоресцентные метки, биотин, аминогруппы и фосфатные группы подтверждаются специализированными реакциями и аналитическими методами.
Паспорт продукта
Данные для воспроизводимой работы в лаборатории
Паспорт связывает заказанную конструкцию с фактически выданным материалом и помогает корректно приготовить рабочие растворы.
Идентификация
Название позиции и последовательность в направлении 5′→3′.
Количество
Оптические единицы, определённые спектрофотометрически.
Концентрация
Значения в молярных и массовых единицах, рассчитанные по последовательности и молярной массе.
Характеристики
Длина, молярная масса, модификации и применённый способ очистки.
Хранение
Сохраните качество после получения
Условия хранения зависят от концентрации, формата и наличия флуоресцентной метки. Для долгой работы удобнее заранее подготовить аликвоты.
Короткое хранение раствора
При концентрации выше 150 нг/мкл (около 20 мкМ) водный раствор допускается хранить при 25 °C ориентировочно 1–2 недели.
Длительное хранение
При меньшей концентрации или длительном использовании рекомендуется −20 °C.
Циклы замораживания
Для разбавленных растворов следует избегать частого размораживания и повторного замораживания.
Флуоресцентные метки
Меченые олигонуклеотиды хранят в темноте и защищают от загрязнения нестерильными предметами.
Практические вопросы
Перед выбором параметров
ОЕ — это фиксированное количество нмоль?
Нет. Оптическая единица связана с поглощением при 260 нм, а перевод в моль и массу зависит от длины, состава, последовательности и модификаций.
Почему очистка и контроль качества выбираются отдельно?
Очистка физически отделяет целевой продукт от примесей, а контроль подтверждает конкретные свойства уже полученного материала.
Можно ли получить продукт сразу в растворе?
Да, если такой формат доступен в текущем справочнике. Обычно используется деионизированная вода Milli-Q; точные условия фиксируются в запросе.
Параметры синтеза
Соберите продукт под конкретную задачу
Каждый параметр влияет на применение, подготовку образца или подтверждение результата. Изучите варианты до перехода в конструктор.
Конструкция
Производство и поставка
Как оформить
Понятный путь от последовательности до запроса
- 01Добавьте последовательности
Введите одну позицию вручную или импортируйте список.
- 02Настройте параметры
Выберите фасовку, очистку, контроль, формат и модификации.
- 03Проверьте и рассчитайте
Исправьте замечания и проверьте предварительную стоимость.
- 04Отправьте запрос
Передайте подготовленный состав для подтверждения условий.
Инструменты
Выберите удобный способ подготовки
Одна последовательность
Расширенная форма для точной настройки конструкции и производственных параметров.
Несколько последовательностей
Список с редактором строк, массовыми действиями, импортом и проверкой.
Импорт файла
Сопоставление колонок, предварительный просмотр и пакетная подготовка данных.
Перед оформлением
Что важно учесть
Q01Очистка и контроль качества — это одно и то же?
Нет. Очистка удаляет побочные продукты синтеза, а контроль качества подтверждает выбранные характеристики готового продукта.
Q02Когда выбирать большую фасовку?
Ориентируйтесь на необходимое количество материала и планируемое число экспериментов. На странице фасовок можно сравнить изменение удельной стоимости.
Q03Можно ли подготовить большой список?
Да. Конфигуратор поддерживает импорт, сопоставление колонок, предварительную проверку и массовые действия.
Q04Является ли расчёт окончательной ценой?
Нет. Это предварительный расчёт по выбранным параметрам. Итоговые условия подтверждаются после отправки запроса.
Готовы начать?
Подготовьте последовательности и получите предварительный расчёт
Конструктор сохранит выбранные параметры, покажет замечания и поможет собрать состав запроса.