Оцените расход
Учитывайте число реакций, повторов и планируемый срок использования.
Количество продукта
Фасовка в оптических единицах определяет ориентировочное количество продукта. Большая фасовка обычно снижает удельную стоимость, но выбирать её нужно по реальной потребности лаборатории.
Учитывайте число реакций, повторов и планируемый срок использования.
График показывает, как меняется стоимость одной буквы на 1 ОЕ.
Фасовка и количество отдельных упаковок задаются независимо.
Оптические единицы
Олигонуклеотиды поглощают УФ-свет в области 260 нм. Перевод оптической плотности в молярную и массовую концентрацию зависит от состава, последовательности, молярной массы и модификаций.
Поглощение измеряют при 260 нм в кювете с известной длиной оптического пути.
Он зависит от состава и порядка оснований, поэтому рассчитывается для конкретной последовательности.
Показывает число молекул в объёме раствора.
Рассчитывается с учётом молярной массы всей конструкции.
Что такое ОЕ
Для раствора объёмом 1 мл и оптического пути 1 см значение A260 используется как количественная характеристика олигонуклеотида.
Пурины и пиримидины имеют разные коэффициенты поглощения, а стэкинг соседних оснований дополнительно меняет итоговое значение.
Красители и другие группы могут вносить вклад в молярную массу и оптические свойства конструкции.
Одинаковая оптическая плотность может соответствовать разному количеству вещества для разных последовательностей.
Для готового продукта указываются рассчитанные молярная и массовая концентрации.
Планирование заказа
Большая фасовка обычно снижает стоимость одной буквы на 1 ОЕ, но избыточный объём усложняет хранение и может не использоваться полностью.
Оцените расход на одну постановку, технические повторы и запас на оптимизацию.
Переведите требуемую концентрацию и объём в общее количество вещества.
Для длинных проектов разумно предусмотреть аликвоты и ограничить циклы замораживания.
Несколько отдельных упаковок и фасовка в ОЕ — разные параметры заказа.
Практические вопросы
Часть производственных операций имеет фиксированную стоимость, поэтому при большем количестве она распределяется на больший объём продукта.
Точный перевод требует последовательности, коэффициента экстинкции и молярной массы; эти значения рассчитываются для конкретной конструкции.
Нет. Число отдельных упаковок задаётся отдельно от общего количества в ОЕ.
В расчёте используются только активные фасовки из справочника.
График показывает ориентировочную стоимость синтеза одной стандартной буквы в пересчёте на 1 ОЕ. При большей фасовке удельная цена снижается.
| Фасовка | Цена одной буквы на 1 ОЕ | Изменение к минимальной фасовке |
|---|---|---|
| 1 ОЕ | 35 ₽ | базовая |
| 2 ОЕ | 17.5 ₽ | −50,0% |
| 5 ОЕ | 10.6 ₽ | −69,7% |
| 10 ОЕ | 7.7 ₽ | −78,0% |
| 20 ОЕ | 5.7 ₽ | −83,7% |
| 50 ОЕ | 4.26 ₽ | −87,8% |
| 100 ОЕ | 3.49 ₽ | −90,0% |
| 200 ОЕ | 2.91 ₽ | −91,7% |
| 500 ОЕ | 2.51 ₽ | −92,8% |
| 1000 ОЕ | 2.26 ₽ | −93,5% |
Расчёт основан на активных ценовых группах стандартных букв A/C/G/T/U и предназначен для сравнения фасовок. Итоговая стоимость строки зависит от длины, модификаций, очистки, контроля и формата.
Следующий шаг
Выберите фасовку и остальные параметры — стоимость пересчитается для всей конструкции.
Каталог, лабораторные расчёты, олиго и помощь по НАНОФОР 05 в одном диалоге.
Опишите лабораторную задачу обычными словами. Я подключу подходящий проверенный инструмент СИНТОЛ.
Критические процедуры остаются привязаны к утверждённым данным и справочникам.