Фитосанитарная молекулярная диагностика
От культуры и возбудителя к лабораторному тесту
Решения СИНТОЛ для выявления фитопатогенов объединяют подготовку растительного материала, выделение нуклеиновых кислот и ПЦР-РВ/ОТ-ПЦР-РВ по конкретной мишени. Подбор удобнее начинать с культуры и предполагаемого возбудителя.
Линейка «ФИТОСКРИН» включает продукты для выделения нуклеиновых кислот и наборы для выявления ДНК или РНК конкретных фитопатогенов. Страница помогает выбрать решение по типу образца, культуре, группе возбудителя и методу анализа.
Задачи лаборатории
- подготовить растительный материал к выделению нуклеиновых кислот;
- выбрать ручной или автоматизированный способ выделения;
- работать со сложными растительными образцами и, для соответствующих продуктов, с почвенными или богатыми гуминовыми кислотами матрицами;
- выявить ДНК бактериального, грибного/оомицетного или нематодного фитопатогена;
- выявить РНК вируса или вироида методом ОТ-ПЦР-РВ;
- подобрать набор по культуре и целевому возбудителю;
- проверить совместимость конкретного набора с лабораторным оборудованием.
Последовательность анализа
Подготовка образца
При необходимости выполняют гомогенизацию и буферную обработку растительного материала.
Выделение нуклеиновых кислот
В зависимости от образца могут применяться «ФитоСорб», «ФитоСорб-П», «Фитоскрин-Экспресс», CytoSorb и документированные автоматизированные варианты.
Автоматизация
Для отдельных продуктов указаны конкретные станции, включая KingFisher Flex и TECAN.
Выявление мишени
Для ДНК-мишеней применяется ПЦР-РВ, для РНК-мишеней — ОТ-ПЦР-РВ в тех наборах, где это предусмотрено.
Портфель включает несколько вариантов выделения нуклеиновых кислот и большую серию PH/PV-наборов. В ней представлены решения для бактерий, грибов и оомицетов, нематод, вирусов и вироидов, а также для разных групп сельскохозяйственных, декоративных и древесных растений.
Ключевые методы — подготовка и гомогенизация растительного материала, выделение ДНК/РНК, автоматизация выделения, ПЦР-РВ и ОТ-ПЦР-РВ.
Продукты для ключевых этапов
Для выделения нуклеиновых кислот используются «ФитоСорб», «Фитоскрин-Экспресс», CytoSorb и автоматизированные варианты. PH/PV-наборы сгруппированы по культуре и возбудителю; PH-001, PH-100m, PV-005 и PH-072 показывают разные типы задач без попытки перечислить всю линейку на одной странице.
Набор реагентов «Phytophthora infestans-РВ» для выявления ДНК возбудителя фитофтороза
Набор реагентов "Acidovorax citrulli-РВ"
Набор реагентов "Beet necrotic yellow vein virus-РВ"
Набор реагентов "Tomato yellow leaf curl disease-РВ" для выявления ДНК бегомовирусов, возбудителей болезни желтой курчавости листьев томата
Набор реагентов "Tomato ringspot virus-РВ" для выявления РНК вируса кольцевой пятнистости томата
Набор реагентов "Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis-РВ"
Набор реагентов "Tomato spotted wilt virus-РВ" для выявления РНК вируса бронзовости томата
Набор реагентов "Tomato brown rugose fruit virus-РВ" для выявления РНК вируса коричневой морщинистости плодов томата
Набор реагентов "Pepino mosaic virus-РВ"
Перейти от задачи к конкретным ресурсам
Инструкция по применению — PH-520
Открыть документ↗Инструкция по применению — PH-522
Открыть документ↗Инструкция по применению — PH-524
Открыть документ↗Инструкция по применению PH-001
Открыть документ↗Инструкция по применению — PH-100m
Открыть документ↗Инструкция по применению — PH-064
Открыть документ↗Инструкция по применению — PH-072
Открыть документ↗Методические рекомендации для диагностики фитопатогенов методом полимеразной цепной реакции в реальном времени
Открыть документ↗«Фитоскрин» - технология быстрой молекулярно-генетической диагностики заболеваний растений
Открыть материал↗Обучение пользователей
Практическое обучение пользователей работе с реагентами, протоколами и лабораторными сценариями.
Открыть услугу↗Регуляторный контекст и ограничения
Чувствительность, специфичность и время анализа зависят от конкретного набора и протокола. Карантинный статус, географическое распространение и нормативный статус возбудителя указываются только по датированному авторитетному источнику.
Подобрать тест
Основное действие — «Подобрать тест по культуре и возбудителю». Дополнительно — «Подобрать выделение нуклеиновых кислот», «Проверить совместимость с оборудованием», «Запросить обучение».
Сформировать запрос