Генотипирование овец по 12 STR-локусам и локусу амелогенина с помощью набора реагентов «Gene Profile Sheep»
Набор реагентов «Gene Profile Sheep» предназначен для генетической идентификации и определения родства овец. В основе работы набора лежит мультиплексная амплификация 12 STR-локусов и локуса амелогенина с последующим анализом длин ПЦР-продуктов методом капиллярного электрофореза. Таблица 1.
Набор реагентов «Gene Profile Sheep» предназначен для генетической идентификации и определения родства овец.
В основе работы набора лежит мультиплексная амплификация 12 STR-локусов и локуса амелогенина с последующим анализом длин ПЦР-продуктов методом капиллярного электрофореза.
| Краситель | Локус | Хромосомная локализация | Структура повтора | Диапазон аллелей |
|---|---|---|---|---|
| Blue | OarFCB20 | 2 | (TG)n | 75-115 |
| AMEL | Y/X | |||
| McM527 | 5 | (TG)n | 158-182 | |
| CSRD247 | 14 | (CA)n | 205-261 | |
| Green | INRA006 | 1 | (CA)n | 106-134 |
| INRA063 | 14 | (AC)n | 165-215 | |
| ETH152 | 5 | (AC)n | 184-200 | |
| Yellow | INRA172 | 22 | (TG)n | 126-172 |
| MAF065 | 15 | (CA)n | 115-139 | |
| MAF214 | 16 | (GT)n | 175-267 | |
| Red | McM042 | 3p | (AC)n | 81-107 |
| INRA005 | 10 | (GT)n | 123-155 | |
| INRA023 | 1 | (AC)n | 190-224 |
Используемые в наборе праймеры мечены флуоресцентными красителями, детектируемыми в каналах Blue, Green, Yellow, Red. Стандарт длин СД-340 мечен красителем Orange. Использование пяти красителей позволяет одновременно детектировать 13 ампликонов и стандарт длин в одном капилляре.
Основные преимущества набора Gene Profile Sheep:
- Возможность внесения в реакцию амплификации широкого диапазона концентраций ДНК (от 5 до 40 нг)
- Возможность внесения 0,5 мкл цельной крови непосредственно в приготовленную реакционную смесь, минуя стадию выделения ДНК (прямая ПЦР)
- Возможность внесения цельной крови, разведенной в воде (1/50) в приготовленную реакционную смесь, минуя стадию выделения ДНК (прямая ПЦР)
- Время амплификации — 1 час 20 минут.
Поделиться статьёй
Сохраните ссылку или отправьте материал коллегам.
