Генотипирование свиней по 21-му STR локусу с помощью набора реагентов «Gene Profile Pig +»
Набор реагентов «Gene Profile Pig +» предназначен для проведения микросателлитного анализа (генотипирования) свиней по 21-му STR локусу
Набор реагентов «Gene Profile Pig +» предназначен для проведения микросателлитного анализа (генотипирования) свиней по 21-му STR локусу
В основе работы набора лежит мультиплексная амплификация 21-го STR-локуса с последующим анализом длин ПЦР-продуктов методом капиллярного электрофореза.
Все представленные в наборе STR-локусы являются динуклеотидными.
| Краситель | Локус | Хромосомная локализация | Структура повтора | Диапазон длин ампликонов, п.о. | Диапазон аллелей |
|---|---|---|---|---|---|
| Blue | SW936 | 15 | (GT)n | 90-116 | 12-25 |
| SW857 | 14 | (TG)n | 132-162 | 9-24 | |
| S0225 | 18 | (AC)n | 170-196 | 8-21 | |
| S0005 | 5 | (AC)n | 205-275 | 15-50 | |
| Green | SW240 | 2p | (TG)n | 96-116 | 15-25 |
| SW951 | 10 | (TA)n | 119-135 | 7-15 | |
| S0155 | 1q | (GT)n | 150-168 | 20-29 | |
| SW632 | 7 | (AC)n/(CA)n | 174-796 | 16-23 | |
| S0227 | 4 | (TG)n | 224-258 | 6-23 | |
| Yellow | SW24 | 17 | (CA)n | 92-126 | 14-31 |
| S0386 | 11 | (TG)n | 157-177 | 9-19 | |
| S0101 | 7 | (GT)nGAGTTT(GT)n | 196-224 | 13-27 | |
| S0090 | 12 | (TG)n | 232-258 | 16-29 | |
| Red | SW72 | 3p | (TG)n | 101-129 | 9-22 |
| SW911 | 9 | (AC)n | 152-172 | 13-23 | |
| S0228 | 6 | (AC)n | 222-248 | 14-27 | |
| S0355 | 15 | (AC)n | 239-275 | 9-27 | |
| Purple | S0026 | 16 | (CA)n/(AC)n | 92-106 | 16-23 |
| S0215 | 13 | (CT)nCC(CT)n(CA)n | 135-169 | 20-37 | |
| S0226 | 2q | (CA)nTA(CA)nTG(CA)n | 181-205 | 22-34 | |
| S0002 | 3q | (TG)nCC(CT)n(CA)n | 135-169 | 20-37 |
Используемые в наборе праймеры мечены красителями Blue, Green, Yellow, Red, Purple. Стандарт длин СД-300 мечен красителем Orange. Использование шести красителей позволяет одновременно детектировать 21 ампликон и стандарт длин в одном капилляре.
Основные преимущества набора Gene Profile Pig+:
- Увеличенное количество локусов с 16 до 21-го
- Возможность внесения в реакцию амплификации широкого диапазона концентраций ДНК (от 1 до 25 нг).
- Возможность внесения 0,3-0,5 мкл цельной крови непосредственно в приготовленную реакционную смесь минуя стадию выделения ДНК (прямая ПЦР).
- Время амплификации 1 час 20 минут.
Поделиться статьёй
Сохраните ссылку или отправьте материал коллегам.
Связанные материалы
Продукты из материала
