Обнаружение ДНК возбудителя вязкой гнили черники Diaporthe vaccinii с помощью набора реагентов «Diaporthe vaccinii-РВ»

Набор реагентов «Diaporthe vaccinii-РВ»

Diaporthe vaccinii Shear (анаморф Phomopsis vaccinii Shear) – возбудитель вязкой гнили черники. Грибной патоген, поражающий растения рода Vaccinium, в основном клюкву (V.macrocarpon, V.oxycoccos), разные виды голубики (V.angustifolium, V. corymbosum, V.virgatum) и чернику (V.myrtillus).

Гриб поражает кончики неодревесневших побегов и распространяется вниз по стеблю со скоростью в среднем 5,5 см за 2 месяца, уничтожая крупные ветви и приводя к гибели целого растения. Для симптомов, проявляющихся на стеблях растений характерно изменение цвета ксилемы, на листьях можно заметить пятна размером до 1 см. Ягоды пораженного растения приобретают коричневый цвет и увеличиваются в размере.

На небольшие расстояния патоген может распространяться с дождем, однако основным источником заражения является инфицированный посадочный материал. D.vaccinii способен долгое время сохраняться в растительных остатках и на поверхности почвы. На сегодняшний день D.vaccinii включен в список А2 ЕОКЗР. Родиной данного патогена принято считать Северную Америку. По данным ЕОКЗР патоген присутствует в США, Канаде, Чили, Латвии, Китае, Германии, Польше, Румынии.

«Diaporthe vaccinii-РВ»

Набор реагентов для обнаружения ДНК возбудителя вязкой гнили черники Diaporthe vaccinii.

Набор может быть использован в лабораторных центрах и институтах, проводящих контроль фитосанитарного состояния растений, в том числе посадочного материала в целях обнаружения Diaporthe vaccinii. Набор позволяет качественно определить, содержится ли в образце ДНК Diaporthe vaccinii.

Набор реагентов «Diaporthe vaccinii-РВ» позволяет одновременно выявлять в одной реакционной смеси специфичный для вязкой гнили черники фрагмент гена по каналу флуоресценции FAM/Green, а также внутренний положительный контроль (ВПК) – по каналу флуоресценции R6G/HEX/Yellow/VIC.

• Чувствительность
  Чувствительность ПЦР при использовании набора реагентов «Diaporthe vaccinii-РВ» не менее 5,0*10³ копий ДНК в миллилитре пробы.
• Специфичность
  Специфичность – ложноотрицательные результаты при анализе образцов растений, содержащих ДНК целевого объекта, отсутствовали, ложноположительные результаты при анализе образцов ДНК, не содержащих вышеперечисленные специфические фрагменты, отсутствовали.

Набор реагентов апробирован на следующих приборах: Gentier 96Е (Tianlong, Китай), QuantStudio 5 (Thermo Fisher Scientific, США), «CFX96» («BioRad», США), «DT» («ДНК-технология», Россия), «Rotor Gene» (Qiagen), «АНК-32 (32М, 48)» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург, Россия)