Определение количества ТА-повторов в промоторной области гена UGT1A1 с помощью набора реагентов «Синдром Жильбера (Gilbert Syndrome)»
Набор «Синдром Жильбера (Gilbert Syndrome)» позволяет определить количество ТА-повторов в промоторной области гена UGT1A1 методом капиллярного электрофореза.
Набор «Синдром Жильбера (Gilbert Syndrome)» позволяет определить количество ТА-повторов в промоторной области гена UGT1A1 методом капиллярного электрофореза.
Синдром Жильбера – аутосомно-рецессивное наследственное нарушение глюкуронизации билирубина, характеризующееся неконъюгированной гипербилирубинемией. Синдром чаще всего диагностируют после подтверждения отсутствия повреждения печени или явного гемолиза. Синдром Жильбера встречается примерно у 3-10% населения. Однако полногеномные исследования показывают, что этот показатель может быть выше, поскольку синдром иногда характеризуется бессимптомным течением, а проявляется эпизодами желтухи при провоцирующих факторах: на фоне голодания, инфекционных заболеваний, эмоциональной и физической нагрузки и т.д.
Синдром Жильбера обусловлен генетическими вариантами в гене UGT1A1, расположенном на длинном плече хромосомы 2 (2q37), который кодирует фермент уридиндифосфат-глюкуронозилтрансферазу-1A1 (UGT1A1), необходимый для конъюгации и последующей экскреции билирубина. Наиболее частым вариантом является увеличение количества ТА-повторов в промоторной области гена с 6 до 7 (реже до 8-ми). Увеличение количества ТА-повторов в промоторе гена приводит к уменьшению его экспрессии и, как следствие, снижению эффективности процесса конъюгации и выведения билирубина.
Помимо аллелей с 6-ю ТА повторами (UGT1A1*1) и с 7-ю ТА повторами (UGT1A1*28) в промоторной области гена набор позволяет выявлять редкие аллельные варианты: UGT1A1*36 с 5-ю ТА повторами (фенотипически проявляется повышением функциональной активности фермента, обусловленной его повышенной экспрессией), а также UGT1A1*37 с 8-ю ТА повторами, для которого значительно снижена экспрессия UGT1A1 и, как следствие, понижена эффективность конъюгации и экскреции билирубина.
| Ген | Генетический маркер | Возможные генотипы | ||
|---|---|---|---|---|
| UGT1A1 УДФ1–глюкуронилтрансфераза 1 UDP glucuronosyltransferase 1 family, polypeptide A1 OMIM ID: 191740 |
TA (n) | rs8175347 | (ТА)5/(ТА)5 | |
| (ТА)5/(ТА)6 | ||||
| (ТА)6/(ТА)6 | ||||
| (ТА)5/(ТА)7 | ||||
| (ТА)6/(ТА)7 | ||||
| (ТА)5/(ТА)8 | ||||
| (ТА)6/(ТА)8 | ||||
| (ТА)7/(ТА)7 | Клинически значимый генотип | |||
| (ТА)7/(ТА)8 | ||||
| (ТА)8/(ТА)8 | ||||
Особенностью набора является проведение одноэтапной ПЦР, совмещающей стадию выделения ДНК с этапом амплификации в одной пробирке (внесение цельной крови непосредственно в реакционную смесь). Набор адаптирован под генетические анализаторы Нанофор-05 и ABI 3130/3500.
В наборе используются флуоресцентно меченые олигонуклеотиды, детекция осуществляется по каналу FAM. Стандарт длин СД-240, входящий в набор, флуоресцентно мечен красителем серии Sy660.
Только для применения в научно-исследовательских целях. Не для применения в медицине или ветеринарии
Поделиться статьёй
Сохраните ссылку или отправьте материал коллегам.
Связанные материалы
Другие статьи
Материалы по теме и свежие публикации блога.
Подготовка ампликоновых библиотек для массового параллельного секвенирования с помощью набора реагентов «MetaGen-16sRNA»
Применяется в исследовании сложных микробных сообществ, позволяющий с высокой точностью и эффективностью подготовить ДНК для массового параллельного…
Читать
Подготовка геномных библиотек для массового параллельного секвенирования с помощью набора реагентов SyntEra-DNA
Набор реагентов SyntEra предназначен для подготовки геномных библиотек для массового параллельного секвенирования; в статье приведены состав набора и основные…
Читать
Очистка и разделение ДНК по размерам с помощью магнитных частиц SynMag Beads
Сравнение частиц SynMag Beads и AMPure XP beads в протоколе последовательного разделения деградированной ДНК. Шаг разделения равен 0,1 объема частиц от…
Читать