Подготовка ампликоновых библиотек для массового параллельного секвенирования с помощью набора реагентов «MetaGen-16sRNA»
Применяется в исследовании сложных микробных сообществ, позволяющий с высокой точностью и эффективностью подготовить ДНК для массового параллельного секвенирования (МПС)
Применяется в исследовании сложных микробных сообществ, позволяющий с высокой точностью и эффективностью подготовить ДНК для массового параллельного секвенирования (МПС)
Преимуществом набора является широкая совместимость – работает с образцами из любых сред: почва, вода, кишечник, биопленки и др.
Метод фокусируется на таксономическом профилировании, что делает его быстрее и дешевле полногеномного метода.
Ампликоновые библиотеки позволяют изучать метагеномные сообщества через секвенирование конкретных маркерных генов (в наборе используются универсальные праймеры, специфичные к консервативным участкам V3–V4 гипервариабельных областей 16S рРНК).
В праймеры встроены адаптеры для МПС
В набор входит 32/96 пар индексных праймеров
Состав «MetaGen-16sRNA»
| Компонент | NGS-MG-32 | NGS-MG-96 |
|---|---|---|
| MetaGen 2.5х PCR - буфер | 1 мл | 1 мл х 3 |
| MetaGen -pol, 2U | 32 реакции | 96 реакций |
| 2.5 mM Mix dNTPs | 0.5 мл | 0.5 мл х 2 |
| BSA, 40 mg | 100 мкл | 100 мкл |
| F_16S (5 mkM) | 32 реакции | 96 реакций |
| R_16S (5 mkM) | 32 реакции | 96 реакций |
| Dual Index | 32 реакции | 96 реакций |
| Вода для ПЦР (без ДНКаз) | 2 мл | 2 мл х 3 |
Рекомендуемые дополнительные компоненты
- Магнитные частицы для разделения ДНК по размерам
«SynMag Beads», кат. № «SynMag Beads-10» - Набор реагентов для измерения концентрации двуцепочечной ДНК
«СинКвант HS ДНК», кат. № «Е-023-250» - Реакционная смесь для проведения ПЦР-РВ в присутствии красителя
SybrGreen I, «M-439», кат. № «М-439» - Набор для выделения растительной и пищевой продукции
«Сорб-ГМО-Б», кат. № GM-503-50 - Набор для выделения из тканей животных и человека
«ДНК Экстран 2», кат. № EX-511
Поделиться статьёй
Сохраните ссылку или отправьте материал коллегам.
Связанные материалы
