Обнаружение ДНК возбудителя угловатой пятнистости фасоли Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola с помощью набора реагентов «Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola-РВ»

Набор реагентов «Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola-РВ»

Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola (Burkholder 1926) Gardan et al. 1992 – возбудитель угловатой пятнистости фасоли. Угловатая пятнистость фасоли распространена более чем в 50 странах. Основными растениями-хозяевами являются представители бобовых, в частности, фасоль обыкновенная Phaseolus vulgarisи некоторые сорные растения. Первичное распространение бактерий происходит с семенным материалом, вторичное – от семян к сеянцам, с ветром и дождем. На инфицированных семенах не всегда заметны признаки поражения. Недоразвитые семена отличаются желтоватым или кремовым оттенком и обладают низкой всхожестью.

В зависимости от условий среды симптомы поражения могут варьироваться, но чаще всего проявляются в виде деформации, увядании и усыхании листьев растений, появляются водянистые красно-коричневые пятна с хлоротичным ореолом.

«Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola-РВ»

Набор реагентов для обнаружения ДНК возбудителя угловатой пятнистости фасоли Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola.

Набор может быть использован в лабораторных центрах и институтах, проводящих контроль фитосанитарного состояния растений, в том числе посадочного материала в целях обнаружения Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola. Набор позволяет качественно определить, содержится ли в образце ДНК Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola.

Набор реагентов «Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola-РВ» позволяет одновременно выявлять в одной реакционной смеси специфичный для угловатой пятнистости фасоли фрагмент гена (по каналу флуоресценции FAM/Green, а также внутренний положительный контроль (ВПК) – по каналу флуоресценции Cy5/Red.

• Чувствительность
  Чувствительность ПЦР при использовании набора реагентов «Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola-РВ» не менее 7,0*10³ копий ДНК в миллилитре пробы.
• Специфичность
  Специфичность – ложноотрицательные результаты при анализе образцов растений, содержащих ДНК целевого объекта, отсутствовали, ложноположительные результаты при анализе образцов ДНК, не содержащих вышеперечисленные специфические фрагменты, отсутствовали.

Набор реагентов апробирован на следующих приборах: Gentier 96Е (Tianlong, Китай), QuantStudio 5 (Thermo Fisher Scientific, США), «CFX96» («BioRad», США), «DT» («ДНК-технология», Россия), «Rotor Gene» (Qiagen), «АНК-32 (32М, 48)» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург, Россия)