Функциональная конструкция

Добавьте модификации под метод и задачу

Метки, гасители, линкеры и другие группы задают функциональность олигонуклеотида. Перед выбором проверьте назначение, позицию и совместимость.

Рассчитать заказ О синтезе

Изучить параметр Выбрать в конструкторе Отправить запрос

Выберите функцию

Начните с того, какую роль должна выполнять модификация в эксперименте.

Проверьте позицию

Не каждая группа доступна одновременно на 5′-, 3′- и внутренней позиции.

Сравните стоимость

Цена зависит от выбранной модификации и фасовки продукта.

Функциональные группы

Модификация должна решать конкретную экспериментальную задачу

Позиция, способ введения, очистка и обозначение в sequence так же важны, как название группы. Каталог ниже показывает реальные символы и допустимые положения.

5′ концевая модификация

Часто используется для меток, фосфатов, линкеров и защитных групп.

3′ концевая модификация

Может задавать метку, гаситель, блокирование удлинения или связь с носителем.

Internal внутренняя позиция

Обычно требует специального модифицированного основания или линкера.

≥95% чистота флуоресцентных продуктов

Для очищенных флуоресцентно-меченых конструкций заявляется чистота не менее 95%.

Основные классы

Выберите функцию, а затем конкретный символ

Разные классы модификаций меняют оптические, химические или биологические свойства олигонуклеотида.

Флуорофоры

Используются для детекции. Могут располагаться на 5′-, 3′-конце или внутри цепи при наличии подходящей химии.

Гасители

Поглощают энергию флуорофора и используются в зондах; рабочий диапазон должен перекрывать эмиссию красителя.

Биотин

Обеспечивает высокоаффинное связывание с авидином и стрептавидином для иммобилизации и детекции.

Аминолинкеры

Создают реакционноспособную группу для постсинтетической конъюгации; доступны на концах и во внутренней позиции.

Спейсеры

Задают расстояние между участками, заменяют неопределённый фрагмент или отделяют метку от последовательности.

Фосфотиоатные связи

Повышают устойчивость к нуклеазам и применяются в антисенсовых и других задачах, требующих защиты цепи.

Флуоресцентные метки

Способ введения влияет на позицию, выход и фон

Краситель может вводиться непосредственно при синтезе, через модифицированную подложку CPG или постсинтетически через аминолинкер.

Амидофосфит красителя

Позволяет встроить метку по протоколу твёрдофазного синтеза в допустимую позицию.

Модифицированная CPG

Используется для некоторых 3′-концевых красителей.

Постсинтетическая конъюгация

Активированное производное красителя реагирует с аминолинкером; такой маршрут требует дополнительной очистки.

Внутренняя метка

Часто требует модифицированного dT-линкера и отдельного символьного кода.

Очистка и контроль

Модифицированный продукт требует удаления свободной метки и непрореагировавшей цепи

Для флуоресцентных конструкций применяется многостадийное разделение, затем подтверждаются оптические свойства и полноразмерность.

Первая стадия

Гель-фильтрация удаляет свободный краситель и соли.

Вторая стадия

ВЭЖХ или ПААГ отделяют меченый олигонуклеотид от непрореагировавшей цепи.

Спектрофотометрия

Спектр помогает подтвердить вклад красителя и нуклеотидной части.

Капиллярный электрофорез

Для ряда флуоресцеин-меченых продуктов используется дополнительный контроль разделения.

Практические вопросы

Перед выбором параметров

Почему natural symbol и symbol могут различаться?

Публичное название описывает химическую группу, а технический symbol кодирует конкретную позицию и способ записи в последовательности.

Можно ли поставить один краситель в любую позицию?

Нет. Допустимые 5′-, 3′- и внутренние положения зависят от конкретной химии и отражены в справочнике.

Почему внутренние модификации сложнее?

Они требуют модифицированного основания или линкера и могут добавлять отдельные стадии синтеза и очистки.

Список модификаций

Выберите группу, найдите модификацию по символу или названию и сравните ориентировочную стоимость для доступных фасовок.

Все примененияПолный список 5′5′-конец 3′3′-конец ВнутриВнутренняя позиция ФлуорофорыСигнальные метки ГасителиQuencher-модификации Для зондовФлуорофоры и гасители

Быстрый поиск: FAMфлуорофор BHQ1гаситель MGB3′-модификация зонда 2-APвнутренняя/концевая модификация

Как читать каталог модификаций

Модификация важна не только сама по себе, но и тем, где она может стоять в последовательности. Перед заказом проверьте расположение, спектральные параметры и совместимость с очисткой.

Подбор зондов

5′-конец39 вариантов

Чаще используется для флуорофоров, биотина, фосфатных и других терминальных меток.

3′-конец26 вариантов

Обычно подходит для гасителей, блокирующих групп и терминальных модификаций зонда.

Внутренняя позиция30 вариантов

Подходит для dT/dC-модификаций и конструкций, где метка должна быть внутри цепи.

Флуорофоры / гасители29 / 9

Для зондов сравнивайте λem красителя с диапазоном гашения, а не только названия.

Найдено модификаций: 26

применение: 3′-конец

Сбросить фильтры

№	Симв. код	Название	Расположение	Экстинкция	Молек. масса	Цена ?
Флуорофоры
1	`Cy3`Cy3 флуорофор	Индокарбоцианин— Пример 5′:`Cy3/ACGTACGT`	5′/3′	4	841	от 196 ₽
2	`Cy3.5`Cy3.5 флуорофор	Дибензоиндо-карбоцианин— Пример 5′:`Cy3.5/ACGTACGT`	5′/3′	24	868	от 196 ₽
3	`Cy5`Cy5 флуорофор	Индодикарбоцианин— Пример 5′:`Cy5/ACGTACGT`	5′/3′	10	870	от 98 ₽
4	`Cy5.5`Cy5.5 флуорофор	Дибензоиндо-дикарбоцианин— Пример 5′:`Cy5.5/ACGTACGT`	5′/3′	21	967	от 98 ₽
5	`Cy7.5`Cy7.5 флуорофор	Cy7.5— Пример 5′:`Cy7.5/ACGTACGT`	5′/3′	—	964	от 196 ₽
6	`FAM`FAM флуорофор	Карбоксифлуоресцеин— Пример 5′:`FAM/ACGTACGT`	5′/3′	21	537	от 98 ₽
7	`R6G`R6G флуорофор	Карбоксиродамин-6G— Пример 5′:`R6G/ACGTACGT`	5′/3′	21	622	от 98 ₽
8	`ROX`ROX флуорофор	Карбокси-Х-родамин— Пример 5′:`ROX/ACGTACGT`	5′/3′	21	922	от 98 ₽
9	`Sy698-C3-N3`Sy698 флуорофор	краситель Sy698— Пример 5′:`Sy698-C3-N3/ACGTACGT`	5′/3′	—	843	от 196 ₽
10	`TAMRA`TAMRA флуорофор	Карбокситетраметил-родамин— Пример 5′:`TAMRA/ACGTACGT`	5′/3′	32	746	от 98 ₽
Гасители флуоресценции
11	`BHQ1`BHQ1 гаситель	Black Hole Quencher-1<p>With the growing popularity of red and near-infrared dyes, we are offering the Black Hole QuencherTM dyes (BHQs). BHQ dyes are robust dark quenchers that very nicely complement our existing product line. They ar… Пример 5′:`BHQ1/ACGTACGT`	5′/3′	8	569	от 98 ₽
12	`BHQ2`BHQ2 гаситель	Black Hole Quencher-2— Пример 5′:`BHQ2/ACGTACGT`	5′/3′	8	571	от 98 ₽
13	`BHQ3`BHQ3 гаситель	Black Hole Quencher-3— Пример 5′:`BHQ3/ACGTACGT`	5′/3′	13	612	от 98 ₽
14	`MGB`MGB гаситель	minor groove binding— Пример 3′:`ACGTACGT/MGB`	3′	—	831	от 1 145 ₽
15	`RTQ1`RTQ1 гаситель	Real Time Quencher-1— Пример 5′:`RTQ1/ACGTACGT`	5′/3′	8	660	от 98 ₽
Нуклеиновые основания
16	`I`I	Инозин— Пример 5′:`I/ACGTACGT`	5′/X/3′	7	331	от 11 ₽
Аффинные метки
17	Biotin 3`	3'-BiotinTEG на CPG (Glen Research)— Пример 3′:ACGTACGT/Biotin 3`	3′	—	569	от 98 ₽
Спейсеры
18	`PC Spacer`	Фотоотщепляемый спейсер— Пример 5′:`PC Spacer/ACGTACGT`	5′/3′	—	344	от 51 ₽
Без группы
19	`2-AP`	2-аминопурин— Пример 5′:`2-AP/ACGTACGT`	5′/X/3′	—	313	от 108 ₽
20	`3'-Cholesteryl-TEG`3'-Cholesteryl-TEG	1-Dimethoxytrityloxy-3-O-(N-cholesteryl-3-aminopropyl)-triethyle— Пример 3′:`ACGTACGT/3'-Cholesteryl-TEG`	3′	—	756	от 196 ₽
21	`3'-NH2-APS`NH2	3'-аминолинкер-APS— Пример 3′:`ACGTACGT/3'-NH2-APS`	3′	—	212	от 51 ₽
22	`5'-NH2-`NH2-	Аминолинкер С6— Пример 5′:`5'-NH2-/ACGTACGT`	5′/3′	—	180	от 51 ₽
23	`5niInd`	5-нитроиндол— Пример 5′:`5niInd/ACGTACGT`	5′/X/3′	—	332	от 108 ₽
24	`P`P	Фосфат— Пример 5′:`P/ACGTACGT`	5′/3′	—	80	от 51 ₽
25	`PR`	6-гексинил-1-ол— Пример 5′:`PR/ACGTACGT`	5′/3′	—	244	от 98 ₽
26	`SH` гаситель	Тио— Пример 3′:`ACGTACGT/SH`	3′	—	322	от 51 ₽

Следующий шаг

Соберите модифицированную последовательность

Используйте каталог как справочник, а окончательную конструкцию задайте в редакторе.

Перейти к заказу Настроить одну позицию