Функциональная конструкция

Добавьте модификации под метод и задачу

Метки, гасители, линкеры и другие группы задают функциональность олигонуклеотида. Перед выбором проверьте назначение, позицию и совместимость.

Рассчитать заказ О синтезе

Изучить параметр Выбрать в конструкторе Отправить запрос

Выберите функцию

Начните с того, какую роль должна выполнять модификация в эксперименте.

Проверьте позицию

Не каждая группа доступна одновременно на 5′-, 3′- и внутренней позиции.

Сравните стоимость

Цена зависит от выбранной модификации и фасовки продукта.

Функциональные группы

Модификация должна решать конкретную экспериментальную задачу

Позиция, способ введения, очистка и обозначение в sequence так же важны, как название группы. Каталог ниже показывает реальные символы и допустимые положения.

5′ концевая модификация

Часто используется для меток, фосфатов, линкеров и защитных групп.

3′ концевая модификация

Может задавать метку, гаситель, блокирование удлинения или связь с носителем.

Internal внутренняя позиция

Обычно требует специального модифицированного основания или линкера.

≥95% чистота флуоресцентных продуктов

Для очищенных флуоресцентно-меченых конструкций заявляется чистота не менее 95%.

Основные классы

Выберите функцию, а затем конкретный символ

Разные классы модификаций меняют оптические, химические или биологические свойства олигонуклеотида.

Флуорофоры

Используются для детекции. Могут располагаться на 5′-, 3′-конце или внутри цепи при наличии подходящей химии.

Гасители

Поглощают энергию флуорофора и используются в зондах; рабочий диапазон должен перекрывать эмиссию красителя.

Биотин

Обеспечивает высокоаффинное связывание с авидином и стрептавидином для иммобилизации и детекции.

Аминолинкеры

Создают реакционноспособную группу для постсинтетической конъюгации; доступны на концах и во внутренней позиции.

Спейсеры

Задают расстояние между участками, заменяют неопределённый фрагмент или отделяют метку от последовательности.

Фосфотиоатные связи

Повышают устойчивость к нуклеазам и применяются в антисенсовых и других задачах, требующих защиты цепи.

Флуоресцентные метки

Способ введения влияет на позицию, выход и фон

Краситель может вводиться непосредственно при синтезе, через модифицированную подложку CPG или постсинтетически через аминолинкер.

Амидофосфит красителя

Позволяет встроить метку по протоколу твёрдофазного синтеза в допустимую позицию.

Модифицированная CPG

Используется для некоторых 3′-концевых красителей.

Постсинтетическая конъюгация

Активированное производное красителя реагирует с аминолинкером; такой маршрут требует дополнительной очистки.

Внутренняя метка

Часто требует модифицированного dT-линкера и отдельного символьного кода.

Очистка и контроль

Модифицированный продукт требует удаления свободной метки и непрореагировавшей цепи

Для флуоресцентных конструкций применяется многостадийное разделение, затем подтверждаются оптические свойства и полноразмерность.

Первая стадия

Гель-фильтрация удаляет свободный краситель и соли.

Вторая стадия

ВЭЖХ или ПААГ отделяют меченый олигонуклеотид от непрореагировавшей цепи.

Спектрофотометрия

Спектр помогает подтвердить вклад красителя и нуклеотидной части.

Капиллярный электрофорез

Для ряда флуоресцеин-меченых продуктов используется дополнительный контроль разделения.

Практические вопросы

Перед выбором параметров

Почему natural symbol и symbol могут различаться?

Публичное название описывает химическую группу, а технический symbol кодирует конкретную позицию и способ записи в последовательности.

Можно ли поставить один краситель в любую позицию?

Нет. Допустимые 5′-, 3′- и внутренние положения зависят от конкретной химии и отражены в справочнике.

Почему внутренние модификации сложнее?

Они требуют модифицированного основания или линкера и могут добавлять отдельные стадии синтеза и очистки.

Список модификаций

Выберите группу, найдите модификацию по символу или названию и сравните ориентировочную стоимость для доступных фасовок.

Все примененияПолный список 5′5′-конец 3′3′-конец ВнутриВнутренняя позиция ФлуорофорыСигнальные метки ГасителиQuencher-модификации Для зондовФлуорофоры и гасители

Быстрый поиск: FAMфлуорофор BHQ1гаситель MGB3′-модификация зонда 2-APвнутренняя/концевая модификация

Как читать каталог модификаций

Модификация важна не только сама по себе, но и тем, где она может стоять в последовательности. Перед заказом проверьте расположение, спектральные параметры и совместимость с очисткой.

Подбор зондов

5′-конец39 вариантов

Чаще используется для флуорофоров, биотина, фосфатных и других терминальных меток.

3′-конец26 вариантов

Обычно подходит для гасителей, блокирующих групп и терминальных модификаций зонда.

Внутренняя позиция30 вариантов

Подходит для dT/dC-модификаций и конструкций, где метка должна быть внутри цепи.

Флуорофоры / гасители29 / 9

Для зондов сравнивайте λem красителя с диапазоном гашения, а не только названия.

Найдено модификаций: 30

применение: внутренняя позиция

Сбросить фильтры

№	Симв. код	Название	Расположение	Экстинкция	Молек. масса	Цена ?
Флуорофоры
1	`dT-6FAM-C8N3`FAM флуорофор	Внутренний 6FAM через клик-химию на длинном линкере— Пример внутри:`AC(dT-6FAM-C8N3)GTAC`	T	30	971	от 481 ₽
2	`T-Cy5`Cy5 флуорофор	Cy5 (внут. T)— Пример внутри:`AC(T-Cy5)GTAC`	T	19	987	от 240 ₽
3	`T-FAM`FAM флуорофор	6-карбокси-флуоресцеин (внутр. T)— Пример внутри:`AC(T-FAM)GTAC`	T	38	815	от 196 ₽
4	`T-R6G`R6G флуорофор	Карбоксиродамин- 6G (внут. T)— Пример внутри:`AC(T-R6G)GTAC`	T	—	896	от 240 ₽
5	`T-ROX`ROX флуорофор	6-карбокси-Х-родамин (внутр. T)— Пример внутри:`AC(T-ROX)GTAC`	T	—	—	от 196 ₽
6	`T-TAMRA`TAMRA флуорофор	6-карбокситетраметил-родамин (внутр Т)— Пример внутри:`AC(T-TAMRA)GTAC`	T	32	869	от 240 ₽
7	`T-Сy3`Сy3 флуорофор	Cy3 (внут. T)— Пример внутри:`AC(T-Сy3)GTAC`	T	14	1 045	от 240 ₽
8	`T-Сy5`Сy5 флуорофор	Су5 (внут. Т)— Пример внутри:`AC(T-Сy5)GTAC`	T	19	987	от 240 ₽
Гасители флуоресценции
9	`T-BHQ1`BHQ1 гаситель	Black Hole Quencher-1 - внутр. dT<p><a class="float-start me-3" data-fancybox="filemanager" href="https://t.syntol-npk.ru/image/catalog/oligonucleotides/modifications/BHQ-2-dT.png"><img alt="" class… Пример внутри:`AC(T-BHQ1)GTAC`	T	30	955	от 240 ₽
10	`T-BHQ2`BHQ2 гаситель	Black Hole Quencher-2 - внутр. dT— Пример внутри:`AC(T-BHQ2)GTAC`	T	26	957	от 240 ₽
Нуклеиновые основания
11	`I`I	Инозин— Пример 5′:`I/ACGTACGT`	5′/X/3′	7	331	от 11 ₽
12	`SH-dT`	5' Тиотимидин— Пример внутри:`AC(SH-dT)GTAC`	T	9	578	от 51 ₽
Аффинные метки
13	`Biotin-dT`Biotin	Biotin-dT (Glen Research)— Пример внутри:`AC(Biotin-dT)GTAC`	T	9	684	от 196 ₽
Спейсеры
14	`dSpacer`	1',2'-дидезоксирибоза— Пример внутри:`AC(dSpacer)GTAC`	X	—	186	от 51 ₽
15	`Spacer3`	Пропандиол— Пример внутри:`AC(Spacer3)GTAC`	X	—	137	от 51 ₽
16	`Spacer9`	Триэтиленгликоль— Пример внутри:`AC(Spacer9)GTAC`	X	—	220	от 51 ₽
17	`Spacer18`	Гексаэтиленгликоль— Пример внутри:`AC(Spacer18)GTAC`	X	—	344	от 51 ₽
Без группы
18	`2-AP`	2-аминопурин— Пример 5′:`2-AP/ACGTACGT`	5′/X/3′	—	313	от 108 ₽
19	`4-Thio-dT`4-Thio	4-тио-дезокситимидин— Пример 5′:`4-Thio-dT/ACGTACGT`	5′/T	—	320	от 196 ₽
20	`5-I-du`	5-Йод-дезоксиуридин— Пример внутри:`AC(5-I-du)GTAC`	U	—	416	от 11 ₽
21	`5-Me-dC`	5-метилцитидин<p>5'-Dimethoxytrityl-N4-(O-levulinyl-6-oxyhexyl)-5-Methyl-2'-deoxyCytidine,3'-[(2-cyanoethyl)-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite</p> <p>A branching monomer is required to construct comb-like oligonu… Пример внутри:`AC(5-Me-dC)GTAC`	C	5	303	от 24 ₽
22	`5niInd`	5-нитроиндол— Пример 5′:`5niInd/ACGTACGT`	5′/X/3′	—	332	от 108 ₽
23	`6-thio-dG`6-thio	6-thio-dG-CE Phosphoramidite— Пример внутри:`AC(6-thio-dG)GTAC`	G	—	345	от 1 145 ₽
24	`8-oxo-dG`8-oxo	8-oxo-deoxyGuanosine— Пример внутри:`AC(8-oxo-dG)GTAC`	G	5	345	от 196 ₽
25	`Alkyne-dT`Alkyne	Алкин dT фосфорамидит— Пример внутри:`AC(Alkyne-dT)GTAC`	T	—	437	от 196 ₽
26	`Carboxy-dT`Carboxy	5'-Dimethoxytrityl-5-[3-methyl-acrylate]-2'-deoxyUridi— Пример внутри:`AC(Carboxy-dT)GTAC`	T	9	360	от 51 ₽
27	`di-AP`	Диаминопурин— Пример внутри:`AC(di-AP)GTAC`	A	—	344	от 51 ₽
28	`iT`iT	3’-инвертированный T— Пример внутри:`AC(iT)GTAC`	T	—	304.2	от 51 ₽
29	`T-Cholesterol`Cholesterol	Холестерин (внут. Т)— Пример внутри:`AC(T-Cholesterol)GTAC`	T	9	888	от 240 ₽
30	`T-NH2`NH2	амино-С6-Т— Пример внутри:`AC(T-NH2)GTAC`	T	9	458	от 196 ₽

Следующий шаг

Соберите модифицированную последовательность

Используйте каталог как справочник, а окончательную конструкцию задайте в редакторе.

Перейти к заказу Настроить одну позицию